使用 ggplot 绘制具有多个预测变量的模型的一个预测变量

2024-03-23

这是线性模型和 ggplot 的典型示例:

require(ggplot2)

utils::data(anorexia, package = "MASS")

anorex.1 <- glm(Postwt ~ Prewt + Treat + offset(Prewt),
                family = gaussian, data = anorexia)
coef(anorex.1)

   (Intercept)       Prewt   TreatCont     TreatFT 
     49.7711090  -0.5655388  -4.0970655   4.5630627 


ggplot(anorexia, aes(y=Postwt, x=Prewt)) + geom_point() + geom_smooth(method='lm', se=F)

我的问题是由以下方法进行的回归geom_smooth(...)与以下型号不同anorex.1 but is:

coef(lm(Postwt ~ Prewt, data=anorexia))

     (Intercept)       Prewt 
      42.7005802   0.5153804 

我怎样才能绘制模型anorexia1在 ggplot 上?

我可以取截距(49.77)并估计(-0.5655)吗anorexia1 for Prewt并用 geom_abline(..) 绘制它,这是正确的吗?有更简单的解决方案吗?


由于您的模型包含两个预测变量(水平的不同截距值)以及偏移变量,因此不可能直接将其包含在geom_smooth()。一种方法是制作新的数据框dat.new包含的值Prewt对于所有三个级别Treat。然后使用这个新的数据框来预测Postwt使用模型的所有级别的值并将预测值添加到新数据框

new.dat<-data.frame(Treat=rep(levels(anorexia$Treat),each=100),
                    Prewt=rep(seq(70,95,length.out=100),times=3))
anorexia.2<-data.frame(new.dat,Pred=predict(anorex.1,new.dat))
head(anorexia.2)
  Treat    Prewt     Pred
1   CBT 70.00000 80.18339
2   CBT 70.25253 80.29310
3   CBT 70.50505 80.40281
4   CBT 70.75758 80.51253
5   CBT 71.01010 80.62224
6   CBT 71.26263 80.73195

现在,从原始数据框中绘制原始点,并使用包含预测的新数据框添加线条。

ggplot(anorexia,aes(x=Prewt,y=Postwt,color=Treat))+geom_point()+
  geom_line(data=anorexia.2,aes(x=Prewt,y=Pred,color=Treat))
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