purrr 将 t.test 映射到分割的 df 上

2024-03-24

我是新来的咕噜声,Hadley https://stackoverflow.com/users/16632/hadley有前景的函数式编程R库 http://blog.rstudio.org/2015/09/29/purrr-0-1-0/。我正在尝试采用分组和分割数据框并对变量运行 t 检验。使用示例数据集的示例可能如下所示。

mtcars %>% 
  dplyr::select(cyl, mpg) %>% 
  group_by(as.character(cyl)) %>% 
  split(.$cyl) %>% 
  map(~ t.test(.$`4`$mpg, .$`6`$mpg))

这会导致以下错误:

Error in var(x) : 'x' is NULL
In addition: Warning messages:
1: In is.na(x) : is.na() applied to non-(list or vector) of type 'NULL'
2: In mean.default(x) : argument is not numeric or logical: returning NA

我只是误解了如何map作品?或者有更好的方式来思考这个问题吗?


我不完全理解预期的结果,但这可能是答案的起点。map() from purrr uses .x在公式论证中。

这是完成我认为您正在尝试做的事情的一种方法purrr.

mtcars %>%
  split(as.character(.$cyl)) %>%
  map(~t.test(.x$mpg)) 

But, purrr::by_slice()搭配得很好dplyr::group_by().

library(purrr)
library(dplyr)

mtcars %>% 
  dplyr::select(cyl, mpg) %>% 
  group_by(as.character(cyl)) %>%
  by_slice(~ t.test(.x$mpg))

或者,你可以跳过purrr完全使用dplyr:::summarise().

library(purrr)
library(dplyr)

mtcars %>% 
  dplyr::select(cyl, mpg) %>% 
  group_by(as.character(cyl)) %>%
  summarise(t_test = data_frame(t.test(.$mpg)))

如果嵌套data.frame令人困惑,broom可以帮助我们轻松获得data.frame结果摘要。

purrr + broom + tidyr

library(broom)
library(tidyr)
mtcars %>%
  group_by(as.character(cyl)) %>%
  by_slice(~tidy(t.test(.x$mpg))) %>%
  unnest()

dplyr + broom

library(broom)

mtcars %>% 
  dplyr::select(cyl, mpg) %>% 
  group_by(as.character(cyl)) %>%
  do(tidy(t.test(.$mpg)))

编辑以包括对评论的回复

有了管道,我们很快就会忘乎所以。我认为沃尔特的回答做得很好,但我想确保我提供了一个purrr-ty 答案。我希望使用pipeR并不过分混乱。

library(purrr)
library(dplyr)
library(broom)
library(tidyr)
library(pipeR)

mtcars %>>%
  (split(.,.$cyl)) %>>%
  (split_cyl~
    names(split_cyl) %>>%
     (
       cross_d(
         list(against=.,tested=.),
         .filter = `==`
       )
     ) %>>%
     by_row(
       ~tidy(t.test(split_cyl[[.x$tested]]$mpg,split_cyl[[.x$against]]$mpg))
     )
  ) %>>%
  unnest()
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