我有一个包含数千行和列的数据框。行包含基因名称,列包含样本名称。
我只想保留 3 个以上样本中包含等于或大于 5 的值的行。
到目前为止我已经尝试过,但我不知道如何设置多个条件:
data.frame1 %>% filter_all(all_vars(.>= 5))
我希望我正确地陈述了这个问题。
我在基因表达过滤预差异基因表达管道中的做法如下:
data.frame1[rowSums(data.frame1 >= 5) > 3, ] -> filtered.counts
如果您的第一列是基因标识符,所有其他列都是数字,则可以让评估跳过第一列,如下所示:
data.frame1[rowSums(data.frame1[-1] >= 5) > 3, ] -> filtered.counts
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