pandas：使用不带引号的文字选项卡编写制表符分隔的数据框

我必须为遗传学软件重新格式化数据，该软件需要将每一列分成两列，例如0-> G G; 1-> A G; 2 -> A A;。输出文件应该以制表符分隔。我正在尝试在 pandas 中做到这一点：

import csv
import pandas as pd
import numpy as np

df = pd.DataFrame(np.random.randint(0,3, size = (10,5)), 
                  columns=[ chr(c) for c in range(97, 97+5) ])

def fake_alleles(x):
    if x==0:
        return "A\tA"
    if x==1:
        return "A\tG"
    if x==2:
        return "G\tG"

plinkpast6 = df.applymap(fake_alleles)
plinkpast6.to_csv("test.ped", sep="\t", quoting=csv.QUOTE_NONE)

这给了我一个错误Error: need to escape, but no escapechar set。还有其他方法可以做到吗pandas?

sep="\t"正在尝试获取数据帧行的每个元素并插入"\t"之间。问题是有"\t"在元素中，它令人困惑。它想让你逃离那些"\t"存在于元素中，而你却没有。我怀疑您希望最终输出为 6 列。

尝试这个：

import csv
import pandas as pd
import numpy as np

df = pd.DataFrame(np.random.randint(0,3, size = (10,20)))

def fake_alleles(x):
    if x==0:
        return "A\tA"
    if x==1:
        return "A\tG"
    if x==2:
        return "G\tG"

plinkpast6 = df.iloc[:,:3].applymap(fake_alleles)
plinkpast6 = plinkpast6.stack().str.split('\t', expand=True).unstack()
plinkpast6.to_csv("test.ped", sep="\t", quoting=csv.QUOTE_NONE)