我应该如何从并行 R 的子实例调用外部程序？该问题也可能发生在其他情况下，但我正在使用library(foreach) and library(doFuture)基于 slurm 的 HPC。作为一个例子，我创建了一个hello.txt其中包含"hello world"，在我的 R 脚本中，我在之前和之内有以下几行%dopar% {}:
message(getwd())
system("echo 'hello directly'")
system("cat hello.txt")
结果在.out的文件sbatch在我要求两个之后，运行看起来像这样%dopar%迭代次数：
/lustre/scratch/myuser
hello directly
hello world
/lustre/scratch/myuser
/lustre/scratch/myuser
Error in { : task 2 failed - "cannot open the connection"
Calls: %dopar% -> <Anonymous>
因此，登录节点上的主 R 实例和计算节点上的子实例似乎具有相同的工作目录，并且处理相同的文件对于早期的原生 R 函数来说并不是问题。但是，执行system()计算节点上由于某种原因失败。有什么帮助吗？
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