Python
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Linux
如何通过点积获得峰值 CPU 性能?
Problem 我一直在研究 HPC 特别是使用矩阵乘法作为我的项目 请参阅我的个人资料中的其他帖子 我在这些方面取得了不错的成绩 但还不够好 我退后一步 看看我在点积计算方面能做得如何 点积与矩阵乘法 点积更简单 并且允许我测试 HPC
c
caching
Optimization
HPC
Linux 中 NDIS 过滤器的类似物是什么?
我正在研究一个as close to real time我在linux中尽可能地使用系统 并且需要在收到特定数据包后立即发送大约600 800字节的TCP数据包 为了获得最佳的延迟 我希望这个数据包直接从内核发送 而不是将接收到的数据包一直
Linux
Kernel
HPC
netfilter
ndis
使用 COMPS 构建 C/C++ 应用程序时出错:硬编码路径
我正在尝试构建一个使用 C C 绑定开发的 COMPASs 应用程序 当我构建应用程序时 出现以下错误 您知道我该如何解决这个问题吗 xxxx xxx c increment gt buildapp increment BSC Barcel
distributedcomputing
HPC
compss
SLURM 每个节点提交多个任务?
我发现了一些非常相似的问题 这些问题帮助我得到了一个似乎有效的脚本 但我仍然不确定我是否完全理解为什么 因此这个问题 我的问题 示例 在 3 个节点上 我想在每个节点上运行 12 个任务 总共 36 个任务 此外 每个任务都使用 OpenM
jobscheduling
HPC
slurm
sbatch
SunGridEngine、Condor、Torque 作为 PVM 的资源管理器
有人知道哪个资源管理器适合 PVM 吗 或者我不应该使用 PVM 而是依赖 MPI 或其任何版本 例如 MPICH 2 还有其他更好的吗 使用 PVM 的主要原因是因为在我之前开始这个项目的人假设使用 PVM 然而 现在这个项目是我的了 他
clustercomputing
HPC
sungridengine
pvm
大规模分布式系统中的日志文件
我在网格和 HPC 领域做了很多工作 对于分布在数百 或在某些情况下数千 服务器上的系统 我们面临的最大挑战之一是分析日志文件 当前日志文件本地写入每个刀片上的磁盘 但我们也可以考虑使用 UDP Appender 等发布日志信息并集中收集
distributedcomputing
HPC
如何在 Chapel 中附加稀疏域
我正在使用读取 CSV 的循环填充 Chapel 中的稀疏数组 我想知道最好的模式是什么 var dnsDom 1 n dims 1 n dims var spsDom sparse subdomain dnsDom for line in
HPC
chapel
R 在 HPC MPIcluster 上运行 foreach dopar 循环
我可以访问带有 MPI 分区的 HPC 集群 我的问题是 无论我尝试什么 我的代码 在我的 PC 上运行良好 都无法在 HPC 集群上运行 代码如下所示 图书馆 TM 图书馆 qdap 图书馆 雪 图书馆 doSNOW 库 foreach
r
foreach
parallelprocessing
MPI
HPC
MPI_Isend 和 MPI_Irecv 似乎导致死锁
我在 MPI 中使用非阻塞通信在进程之间发送各种消息 然而 我似乎陷入了僵局 我用过PADB see here http padb pittman org uk 查看消息队列并得到以下输出 1 msg12 Operation 1 pendi
c
MPI
parallelprocessing
HPC
OpenMPI
为了实现快速读/写性能(在 Python/pandas 中),推荐的 HDF5 压缩是多少?
我曾多次读到 在 HDF5 中打开压缩可以带来更好的读 写性能 我想知道什么理想的设置可以在以下位置实现良好的读 写性能 data df to hdf format fixed complib complevel chunksize 我已经
pandas
Compression
HDF5
HPC
h5py
如何使用 MS HPC Server 2008 R2 的 MPI 堆栈成功编译 mpi4py?
故事是这样的 我需要一个 Python 的 MPI 包装器 我知道有mpi4py http code google com p mpi4py 对于当前的工作 我 大部分 使用 Python 和 Windows 我想使用 Microsoft
python
MPI
HPC
在不同架构的集群上应该指定哪个AVX和march?
我目前正在尝试使用英特尔编译器编译用于 HPC 集群的软件 登录节点是我编译和准备计算的地方英特尔至强金牌 6148 https ark intel com content www us en ark products 120489 int
c
compileroptimization
HPC
avx
ICC
在 HPC 集群上使用 python 代码 (mpi4py) 提交作业
我正在工作带有 MPI 的 python 代码 mpi4py 我想在 HPC 集群的队列中跨多个节点 每个节点有 16 个处理器 实现我的代码 我的代码结构如下 from mpi4py import MPI comm MPI COMM WO
clustercomputing
jobs
jobscheduling
HPC
mpi4py
使用 DAG 的 Condor 作业以及一些需要运行同一主机的作业
我有一个计算任务 它被分成几个具有依赖性的单独程序执行 我使用 Condor 7 作为任务调度程序 使用 Vanilla Universe 由于对程序的限制超出了我的能力范围 因此不涉及检查点 因此 DAG 看起来像是一个自然的解决方案 然
workflow
Distributed
clustercomputing
HPC
condor
OpenMP 和 C++11 多线程
我目前正在从事一个混合高性能计算 HPC 和交互性的项目 因此 HPC 部分依赖于 OpenMP 主要是具有大量相同计算的 for 循环 但它包含在具有 GUI 和多线程的更大框架中 目前通过 c 11 线程实现 std thread an
c
Multithreading
C11
openmp
HPC
Java 中的 Infiniband
众所周知 OFED的Socket Direct协议是已弃用 http en wikipedia org wiki Sockets Direct ProtocolOFED 的 3 x 版本根本不附带 SDP 因此 Java 的SDP http
Java
Sockets
HPC
infiniband
RDMA
在 Visual Studio Code 中使用奇异容器作为 python 解释器
我通过 VScode 远程 ssh 连接到 HPC 环境 并希望直接在 VScode 中运行 python 代码以进行测试 我想将 python 解释器设置为一个在执行时运行 python 的奇点容器 这是通过在容器的 def 文件中添加以
python
VisualStudioCode
HPC
vscoderemote
singularitycontainer
如何检索 slurm 脚本的内容?
我几天前提交了一份工作 现在仍在运行 但我忘记了内容script sh那天 还有script sh已被删除 您知道如何恢复该脚本的内容吗 在最新版本中 您可以使用以下命令检索您自己作业的作业脚本 scontrol write batch s
clustercomputing
HPC
slurm
在集群的节点上启动 Jupyter Notebook(高性能计算或 HPC 设施)
我想在集群的一个节点上运行 jupyter 笔记本 不在登录节点上 我可以在登录节点上远程运行 jupyter 笔记本 但这会不必要地减慢集群的使用速度 请指导我如何从本地桌面在节点上启动 jupyter 笔记本 我们的集群使用PBS作业提
jupyternotebook
clustercomputing
HPC
pbs
qsub
Netlogo HPC CPU 使用百分比增加
我通过以下方式使用无头 NetLogo 将作业提交到 HPC 服务器code bin bash N r20p q all q pe mpi 24 home abhishekb netlogo netlogo 5 1 0 netlogo he
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