ggsurvplot - 轴交叉于 0,0

2024-02-21

Survminer产生不错的情节,但有没有办法进一步改变常规的结果ggplot-命令?

我尝试做的是使 y 轴从原点开始,如上所述here https://stackoverflow.com/questions/13701347/force-the-origin-to-start-at-0-in-ggplot2-r。 对于常规 ggplot,这非常有效,但我无法使其与 survminer 一起工作:

library(survival)
library(survminer)

df<-genfan
df$treat<-sample(c(0,1),nrow(df),replace=TRUE)


fit <- survfit(Surv(hours, status) ~ treat,
               data = df)

p<-ggsurvplot(fit, data = df, risk.table = TRUE,,ncensor.plot=FALSE,tables.theme = theme_cleantable(),
              ggtheme = theme_survminer(font.legend=c(12,"bold","black") ))


p%+%scale_x_continuous(expand=c(0,0))%+%scale_y_continuous(expand=c(0,0))

这会产生一个错误

“‘y’的比例已经存在。为‘y’添加另一个比例,这将取代现有的比例。”

和一个额外的错误

“错误:提供给连续刻度的离散值”

有办法解决这个问题吗?


解决您的问题的一个可能的解决方案是修改ggsurvplot and ggrisktable插入expand=c(0,0)在适当的地方。
在这link https://pastebin.com/rNwRHBzE你可以找到我的建议。
点击“下载”并保存文件a_modified_ggsurvplot.txt在你的工作目录中。
然后运行以下代码:

library(survival)
library(survminer)

df <- genfan
df$treat <- sample(c(0,1),nrow(df),replace=TRUE)
fit <- survfit(Surv(hours, status) ~ treat, data = df)

source("a_modified_ggsurvplot.txt")
p <- myggsurvplot(fit, data = df, risk.table = TRUE,
     ncensor.plot=FALSE,tables.theme = theme_cleantable(),
     ggtheme = theme_survminer(font.legend=c(12,"bold","black")))
print(p)

Here is the plot: enter image description here

希望它可以帮助你。

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