如何在 python 中使用可变宽度高斯函数执行卷积?

2024-02-28

我需要使用高斯执行卷积,但是高斯的宽度需要改变。我不进行传统的信号处理,而是需要根据设备的分辨率获取完美的概率密度函数 (PDF) 并“涂抹”它。

例如,假设我的 PDF 一开始是尖峰/增量函数。我将其建模为非常窄的高斯。经过我的设备运行后,它将根据某种高斯分辨率被涂抹掉。我可以使用 scipy.signal 卷积函数来计算它。

    import numpy as np
    import matplotlib.pylab as plt

    import scipy.signal as signal
    import scipy.stats as stats

    # Create the initial function. I model a spike
    # as an arbitrarily narrow Gaussian
    mu = 1.0 # Centroid
    sig=0.001 # Width
    original_pdf = stats.norm(mu,sig)

    x = np.linspace(0.0,2.0,1000) 
    y = original_pdf.pdf(x)
    plt.plot(x,y,label='original')


    # Create the ``smearing" function to convolve with the
    # original function.
    # I use a Gaussian, centered at 0.0 (no bias) and
    # width of 0.5
    mu_conv = 0.0 # Centroid
    sigma_conv = 0.5 # Width
    convolving_term = stats.norm(mu_conv,sigma_conv)

    xconv = np.linspace(-5,5,1000)
    yconv = convolving_term.pdf(xconv)

    convolved_pdf = signal.convolve(y/y.sum(),yconv,mode='same')

    plt.plot(x,convolved_pdf,label='convolved')
    plt.ylim(0,1.2*max(convolved_pdf))
    plt.legend()
    plt.show()

这一切都没有问题。但现在假设我原来的 PDF 不是一个尖峰,而是一些更广泛的功能。例如,sigma=1.0 的高斯分布。现在假设我的决心实际上varysover x:在 x=0.5 时,涂抹函数是 sigma_conv=0.5 的高斯函数,但在 x=1.5 时,涂抹函数是 sigma_conv=1.5 的高斯函数。假设我知道我的涂抹高斯函数的 x 相关性的函数形式。天真地,我想我应该将上面的行更改为

    convolving_term = stats.norm(mu_conv,lambda x: 0.2*x + 0.1)

但这不起作用,因为范数函数需要宽度值,而不是函数。从某种意义上说,我需要我的卷积函数是一个 2D 数组,其中我对原始 PDF 中的每个点都有不同的涂抹高斯,它仍然是一个 1D 数组。

那么有没有办法用函数来做到这一点alreadyPython 中定义的?我自己编写了一些代码来执行此操作......但我想确保我不仅仅是重新发明了轮子。

提前致谢!

Matt


问题,简而言之:
如何与非平稳核进行卷积,例如,改变数据中不同位置宽度的高斯核,Python 是否是这方面的现有工具?

回答,有点像:
很难证明是否定的,但我不认为 scipy 或 numpy 中存在与非平稳内核执行卷积的函数。不管怎样,正如你所描述的,它不能真正很好地矢量化,所以你最好做一个循环或编写一些自定义的 C 代码。

可能对您有用的一个技巧是,不要通过位置更改内核大小,使用反比例拉伸数据(即,在您希望高斯分布的基本宽度为 0.5 的地方,将数据拉伸至 2 倍)。这样,您可以对数据执行一次扭曲操作,即具有固定宽度高斯的标准卷积,然后将数据恢复到原始比例。

这种方法的优点是它非常容易编写,并且完全矢量化,因此运行起来可能相当快。

扭曲数据(例如,使用插值方法)会导致一些准确性损失,但如果您选择的内容使数据在初始扭曲操作中始终扩展而不是减少,则损失应该是最小的。

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