如何确保同一服务器上不同用户的 R 环境一致？

我正在使用内部软件包“MyPKG”编写可重复分析的协议。每个用户将提供自己的输入文件；除了输入之外，分析应在相同的条件下进行。 （例如，这样我们就可以推断不同的结果是由于不同的输入文件造成的）。

MyPKG 正在开发中，所以library(MyPKG)将加载用户在本地库中编译的最后一个版本。它还将加载在本地库中找到的任何依赖项。

但我希望每个人都使用特定版本（MyPKG_3.14）进行此分析，同时仍然允许开发更新的版本。如果我理解正确，“R --vanilla”将为每个人加载相同的依赖项。

完成后，我们会将工作环境保存为虚拟机，以维持稳定的可重现环境。因此，临时（6 个月）解决方案就足够了。

我提出了两个可能的解决方案，但不确定其中一个是否足够。

1. 要求服务器管理员将 MyPKG_3.14 安装到默认的 R 路径中，然后在协议中提供以下代码：

   R --vanilla
   library(MyPKG)
   ....
   

   or

2. 在特定库中编译 MyPKG_3.14，例如lib.loc = "/home/share/lib/R/MyPKG_3.14"，然后提供

   R --vanilla
   library(MyPKG)
   

• 这两种方法是否足以确保每个人都运行相同的版本？
• 其中一个比另一个更可取吗？
• 是否还有其他可能出现的不可预见的问题？
• 是否有标准化多重分析的首选选项？
• 我应该包括对输出的测试吗SessionInfo()?
• 在服务器上创建一个帐户供每个人使用会更好吗？

几点：

• 使用系统范围内的软件包安装，例如R 的 Debian / Ubuntu 二进制文件（包括 CRAN 端口）将尝试使用/usr/local/lib/R/site-library（如果添加到拥有该目录的组，用户也可以安装）。那样每个人都得到相同的版本
• 使用系统范围的配置，例如更喜欢$R_HOME/etc/在下面的点文件上~/。出于同样的原因，Debian / Ubuntu 软件包提供了软链接/etc/R/
• 用户查询其包的设施（例如installed.packages()) 报告软件包和版本。
• 如果可用，请使用操作系统级别的工具来查询操作系统版本和版本。然而，这还不太标准化。

关于最后一点我家里的盒子说

> edd@max:~$ lsb_release -a | tail -4
> Distributor ID: Ubuntu
> Description:    Ubuntu 12.04.1 LTS
> Release:        12.04
> Codename:       precise
> edd@max:~$ 

这是一个开始。