根据 hcharter 中给定的序列设置热图颜色范围

2024-04-04

在这里我尝试使用创建热图highcharter::hcharter() where 小于-1应该是一种颜色(粉红色),-1 to 1应该是透明或白色的,并且大于+1应该是另一种颜色(紫色)。

目前我已经使用编写代码hchart()并使用color_stops更改颜色格式。但是,当数据以 0 为中心时,这种方法效果非常好,但当数据不以 0 为中心时,比如说-5 至 +7.5白色/透明颜色将转变为 1,如下图所示。

a1 <- rnorm(30,0,2)  
a2 <- rnorm(30,0,2)  
a3 <- rnorm(30,0,2)  
a4 <- rnorm(30,0,2)  
a <- cbind(a1,a2,a3,a4)
heatmap_matrix <- as.matrix(a)

library(highcharter) 
hchart(heatmap_matrix) %>%  
  hc_colorAxis(stops = color_stops(n = 3, colors = c("#FF1493", "white", "#800080")))

对于数据范围之间-5 to +7.5
-5 到 -1 应显示粉红色渐变颜色
-1 到 +1 应显示白色
+1 到 7.5 应显示紫色渐变颜色


论据stops in hc_colorAxis()需要一个将最小值定义为的列表0最大值为1。您可以设置0~1之间的数字来代表某个值的位置并设置其颜色。

找到零所在的位置

p <- (0 - min(heatmap_matrix)) / (max(heatmap_matrix) - min(heatmap_matrix))

设置自定义列表

stops <- data.frame(q = c(0, p, 1),
                    c = c("#FF1493", "#FFFFFF", "#800080"),
                    stringsAsFactors = FALSE)
#          q       c
# 1 0.000000 #FF1493
# 2 0.434873 #FFFFFF
# 3 1.000000 #800080

stops <- list_parse2(stops)

控制参数

hchart(heatmap_matrix) %>%  
  hc_colorAxis(stops = stops, startOnTick = F, endOnTick = F)
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