如何纠正箱线图的标签,获取 R 中每对的 p 值

2024-04-17

我有一个数据样本如下:

df <- tribble(
    ~capacity1, ~capacity2, ~capacity3, ~capacity4, ~capacity5, ~capacity6, ~capacity7, ~capapcity8,
    75, 88, 85, 71, 98, 76, 71, 57,
    80, 51, 84, 72, 59, 81, 70, 64,
    54, 65, 90, 66, 93, 88, 77, 59,
    59, 87, 94, 75, 74, 53, 56, 87,
    52, 55, 64, 77, 50, 64, 83, 87,
    33,22,66,67,99,87,40,90,)

我想得到下面的图表。

如您所见,容量 1 与容量 2 配合使用,并生成一个标签作为容量 1。容量 3,容量 4= 容量 2,容量 5 和容量 6= 容量 3,容量 7,容量 8= 容量 4。接下来,我想获得 p 值。如果我们可以订购每对盒子(例如,容量 1 和容量 2= 容量 1),那就太好了。


如果我们需要成对图,我们可以分成list每对列的数据集,然后使用ggboxplot from ggpubr

library(dplyr)
library(tidyr)
library(purrr)
library(patchwork)
library(rstatix)
library(ggpubr)
lst1 <- df %>% 
        # // split every 2 columns
        split.default(as.integer(gl(ncol(.), 2, ncol(.)))) %>% 
        # // loop over the list
        map(~ {
          # // reshape to long format
           dat <- pivot_longer(.x, everything())
           # // get the t.test p value
           stat_test <- dat %>%
                         t_test(value ~ name)%>% 
                         adjust_pvalue(method = "bonferroni") %>%      
                         add_significance("p.adj") %>% 
                         add_xy_position(x = "name")
        # // create the boxplot
        ggboxplot(dat, x = 'name', y = 'value')+
                   stat_pvalue_manual(stat_test, 
                        label = "p.adj", tip.length = 0.01)
        })       

现在,我们用以下内容包装绘图列表wrap_plots from patchwork

wrap_plots(lst1)

-output

本文内容由网友自发贡献,版权归原作者所有,本站不承担相应法律责任。如您发现有涉嫌抄袭侵权的内容,请联系:hwhale#tublm.com(使用前将#替换为@)

如何纠正箱线图的标签,获取 R 中每对的 p 值 的相关文章

  • R:如何找到向量的模式[重复]

    这个问题在这里已经有答案了 下面是我的data frame我想知道每个内存类别 1 到 8 的模式是什么 gt dput d structure list MEMORY1 c 5 5 7 1 5 6 4 5 4 5 5 4 1 5 5 2
  • matplotlib 中的 R 风格数据轴缓冲区

    R 绘图自动设置 x 和 y 限制 以在数据和轴之间留出一些空间 我想知道 matplotlib 是否有办法自动执行相同的操作 如果没有 是否有一个好的公式或 经验法则 来说明 R 如何设置其轴限制 在 matplotlib 中 您可以通过
  • 在函数中使用 quit/q 会导致 RStudio 出现致命错误

    更多的是好奇 但当你使用时q or quit在 R studio 内的函数内部 它会导致致命错误 如下所示 但 rgui 中的相同函数会导致 R 像往常一样停止 并且仅使用q 在 RStudio 中按预期关闭 R 为什么q在函数中导致 RS
  • 使用自定义渐变填充直方图箱

    我想在 R 和 ggplot2 中创建一个直方图 其中根据连续的 x 值填充箱 大多数教程仅通过离散值或密度 计数进行着色 下列的这个例子 https stackoverflow com questions 40284227 how to
  • 如何使用 R 中的函数 sqlSave() 将数据附加到具有 IDENTITY 主键的 SQL Server 表?

    我在SQL Server中创建了一个表 如下所示 CREATE TABLE testPK ID INT NOT NULL IDENTITY 1 1 PRIMARY KEY NumVal NUMERIC 18 4 现在我想使用 RODBC 函
  • 美人鱼图:调整图表周围的空白

    我在用 Rstudio 编译的 Rmd 报告中使用了美人鱼图 在 HTML PDF 输出中 图表上方和下方有大量空白 请参见下面的示例 Header Text r library DiagrammeR mermaid graph TD cl
  • R data.table 多个条件连接

    我设计了一种解决方案 用于从两个单独数据表的多个列中查找值 并添加基于新列的值计算 多个条件比较 代码如下 它涉及在计算两个表中的值时使用 data table 和联接 但是 这些表没有联接在我正在比较的列上 因此我怀疑我可能无法获得 da
  • 修改linux下的路径

    虽然我认为我已经接近 Linux 专业人士 但显然我仍然是一个初学者 当我登录服务器时 我需要使用最新版本的R 统计软件 R 安装在 2 个地方 当我运行以下命令时 which R I get usr bin R 进而 R version
  • 空间数据xyz到矩阵

    我有一个大数据框 100 000 行 其中包含 LON LAT VALUE 我想将其转换为矩阵 EPSG 中的坐标 3035 我使用以下命令尝试了 reshape2 包 acast df lon lat value var value 效果
  • 在 R 中使用逻辑 grep 抓取文本

    下午好 谢谢你帮我解答这个问题 我有兴趣抓取一组超过 5000 个 URL 的列表 我使用 lapply 和 readLines 使用下面的示例代码提取这些网页的文本 multipleURL lt c http dailymed nlm n
  • 如何从数据框中删除少于 5 个观察值的个体 [重复]

    这个问题在这里已经有答案了 为了澄清这个问题 我将简要描述数据 中的每一行data frame是一个观察值 列代表与该观察值相关的变量 包括 观察到什么个体 观察时间 观察地点等 我想排除 过滤观察值少于 5 个的个体 换句话说 如果 in
  • 在 Lavaan 生长曲线模型中提取个体轨迹

    我已经使用 R 的 Lavaan 包中的 Growth 函数成功地对一项研究的纵向数据进行了建模 我找不到任何关于如何提取每个参与者的预测轨迹的记录 我只能找到整个组的预测轨迹 在摘要输出的 拦截 部分下给出 使用 lavPredict m
  • 通过 Shiny 中的串扰将 Plotly 与 DT 结合使用

    我正在编写一个应用程序来将 csv 文件读取为闪亮的并将散点图与 DT 表链接起来 我几乎遵循了 Plotly 网站上 DT 数据表上的示例 https plot ly r datatable https plot ly r datatab
  • 如何绘制每条线之间具有特定距离的图形

    实际上 我尝试绘制一个图形 但它将所有列 线 放在一起并显示 因此它不具有代表性 我尝试制作模拟数据并向您展示我如何绘制它 并向您展示我想要的内容 我不知道如何制作像下面所示的示例的数据 但我在这里做了什么 set seed 1 M lt
  • R 编程常用工具

    如果已经以不同的方式问过这个问题 我深表歉意 但我找不到任何达到我想要的东西 我真的是从其他软件包 SPSS 开始接触 R 的 当我了解真正可以做什么时 我意识到我还需要其他 工具 这让我想到了我的问题 您有哪些用于开发 R 代码的设置 我
  • 如何将同一行中以逗号分隔的值拆分到R中的不同行

    我有一些数据来自谷歌表格 https forms gle rGQQL3tvA1PrE4dD8我想拆分以逗号分隔的答案 and 复制参与者的 ID 数据如下 gt head data names Q2 Q3 Q4 1 PART 1 fruit
  • R中整数类和数字类有什么区别

    我想先说我是一个绝对的编程初学者 所以请原谅这个问题是多么基本 我试图更好地理解 R 中的 原子 类 也许这适用于一般编程中的类 我理解字符 逻辑和复杂数据类之间的区别 但我正在努力寻找数字类和整数类之间的根本区别 假设我有一个简单的向量x
  • 按特定样本前缀对列名称向量进行子集化

    假设我有一个如下所示的数据框 ca01 lt c 1 10 ca02 lt c 2 11 ca03 lt c 3 12 stuff 1 lt rep test 10 other lt rep 9 10 data lt data frame
  • RStudio 如何确定控制台宽度,为什么它似乎总是出错?

    我刚刚发现wid lt options width在 RStudio 中 它似乎是我日常控制台使用中令人烦恼的根源 或者更确切地说 更接近根源 我应该先说一下 我目前使用的是 R 3 2 2 RStudio 0 99 491 Linux M
  • 不同 R/lme4 版本的单一拟合结果不匹配

    我试图将 R 版本 3 5 3 lme4 1 1 18 1 的随机效应估计与 R 版本 4 1 1 lme4 1 1 27 1 相匹配 然而 当存在奇异拟合时 这两个版本之间的随机效应存在微小差异 我对奇点警告很满意 但令人费解的是不同版本

随机推荐