错误:输入文件并非全部位于同一目录中,请提供显式 wd

2024-04-18

在尝试构建一个大约两周前工作的 PDF 后,没有大惊小怪,在一台全新安装了 R、R studio 的新机器上,bookdown等等,我有这个错误:

Error: Input files not all in same directory, please supply explicit wd

我有以下章节.Rmd文件排序到目录中,所以如果我改变rmd_subdir from true to false,错误消失了,但是...我无法处理项目根目录中每个场景包含 4-7 个场景的 100 多个章节;我会发疯的。

I have new_session: no https://github.com/rstudio/bookdown/issues/887#issuecomment-627136120 in my _bookdown.yml,但这并没有帮助。

我对 R 的了解还不够,甚至无法开始诊断 -谷歌回报4(!) 结果 https://www.google.com/search?q=%22Input%20files%20not%20all%20in%20same%20directory%2C%20please%20supply%20explicit%20wd%22并且全部都是源代码。因此,我不确定此处要包含哪些文件,所以请告诉我,我会将它们粘贴进去。

我如何构建

我按下上面写着的按钮Build Book在 RStudio 中,它会随着滴答作响并退出status 1过了一会儿就出现上面的错误。

确切的错误消息

==> rmarkdown::render_site(output_format = 'bookdown::gitbook', encoding = 'UTF-8')



processing file: book-book.Rmd
  |......................................................................| 100%
  ordinary text without R code


output file: book-book.knit.md

Error: Input files not all in same directory, please supply explicit wd
Execution halted

Exited with status 1.

索引.Rmd

---
title: "F"
author: "TTil"
site: bookdown::bookdown_site
fontsize: 10pt
geometry: paperwidth=6in,paperheight=9in,margin=0.5in,heightrounded,twoside,includehead,includefoot,heightrounded
output:
  bookdown::gitbook:
    split_by: section
    config:
      toolbar:
        position: static
  bookdown::pdf_book:
    keep_tex: yes
    latex_engine: lualatex
    includes:
      in_header: preamble.tex
      before_body: before_body.tex
documentclass: book
link-citations: yes
linestretch: 1.15
links-as-notes: true
mainfont: "Inter"
---

_bookdown.yml

book_filename: 'book-book'
language:
  ui:
    chapter_name: ''
delete_merged_file: true
new_session: no
rmd_subdir: true

# Before We Begin {-}

test test replace me

我的文件结构如下所示:

index.Rmd
  - part-1/
     - ch01/
       - sc01.Rmd
       - sc02.Rmd
       ...
     - ch02/
     ...
  - part-2/
  ... 

因此我期望sc01.Rmd and sc02.Rmd成为第一章,然后它和它的兄弟姐妹第一部分,等等等等第二部分, 第三部分, ...

正如我上面所说,这个 PDF 大约两周前就可以正常工作(尽管是在另一台机器上)。

Cheers.


Update: 这个问题已经在开发版中修复了bookdown: https://github.com/rstudio/bookdown https://github.com/rstudio/bookdown您可以通过安装它remotes::install_github('rstudio/bookdown').


这可能与最近的一个功能bookdown https://github.com/rstudio/bookdown/releases/tag/v0.20。由于您没有提供可重现的示例,我的盲目猜测是该设置options(bookdown.render.file_scope = FALSE)可能会修复它。您可以在 Rmd 文档中设置此选项,或者~/.Rprofile.

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