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如何在h5py中指定自定义压缩过滤器

2024-02-11

根据 h5py 文档，“压缩过滤器可以由底层 HDF5 库动态加载。这是通过将过滤器编号作为压缩参数传递给 Group.create_dataset() 来完成的。”我有以下代码（效果很好）：

import numpy as np
a = np.random.random(1e5)
with h5py.File(args.baseName + '/allubf.h5', libver='latest') as f:
    dset = f.create_dataset('myData', (1000,), dtype=np.dtype(float), chunks=(1000,), compression='lzf', shuffle=True)

我查找了压缩过滤器 IDhere http://www.hdfgroup.org/services/filters.html并尝试将“lzf”替换为 32000，根据上面的链接，这应该是 lzf 的 ID。当我这样做时，我收到错误 ValueError：压缩过滤器“32000”不可用。我找不到更多的文档或示例。我是否需要以某种方式预加载过滤器才能使其可用？


看来文档早于发布的库。 此功能可在GitHub 存储库 https://github.com/h5py/h5py但在 pypi 版本中尚不可用（如果您使用 easy_install 或 pip 安装 h5py，则可以使用此版本）。如果您想使用自定义压缩过滤器，您必须使用 GitHub 中的版本，等待 pypi 版本更新，或者应用这组改变 https://github.com/h5py/h5py/pull/426/files.

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python

HDF5

h5py

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