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是否可以使用 np 数组作为 h5py 数据集中的索引?
我需要将多个数据集 每个数据集包含在一个单独的文件中 合并到属于最终文件的另一个数据集中 当部分数据集中的数据被复制到最终数据集中时 它们的顺序不会保留 部分数据集中的数据通过索引 映射 到最终数据集中 我创建了两个列表 final ind
NumPy
h5py
是否可以使用多处理对一个 h5py 文件进行并行读取?
我正在尝试加快从 h5py 数据集文件中读取块 将它们加载到 RAM 内存中 的过程 现在我尝试通过多处理库来做到这一点 pool mp Pool NUM PROCESSES gen pool imap loader indices 加载器
python
parallelprocessing
h5py
h5py 是否将整个文件读入内存?
h5py是否将整个文件读取到内存中 如果是这样 如果我有一个非常非常大的文件怎么办 如果不是的话 我每次要单个数据就从硬盘取数据会不会很慢 我怎样才能让它更快 h5py是否将整个文件读取到内存中 不 不是的 特别是 切片 dataset 5
python
h5py
如何使用 h5py 保存不同形状的 numpy.arrays 列表?
我正在使用 h5py 将大型图像数据集 flickr25k 数据集 保存到 hdf5 中 但是图像大小不同 因此我无法创建具有形状的数据集 nb images height width 现在我正在使用多个数据集来处理这个问题 因此creat
python
NumPy
HDF5
h5py
无法安装h5py
我正在尝试在 Windows10 64 位 Python 3 8 5 Pip 20 2 4 上使用 h5py 使用了这个命令 pip install h5py 但这会引发错误 ERROR Could not build wheels for
python
Windows
pip
h5py
pep517
将 scipy 稀疏矩阵存储为 HDF5
我想以 HDF5 格式压缩和存储一个巨大的 Scipy 矩阵 我该怎么做呢 我尝试过以下代码 a csr matrix dat row col shape 947969 36039 f h5py File foo h5 w dset f c
python
scipy
sparsematrix
HDF5
h5py
如何在python中读取Mat v7.3文件?
我正在尝试阅读以下网站中给出的mat文件 ufldl stanford edu housenumbers 在文件train tar gz中 有一个名为digitStruct mat的mat文件 当我使用 scipy io 读取 mat 文件
python
MATLAB
HDF5
Mat
h5py
在 Python 中打开 .h5 文件
我正在尝试用 Python 读取 h5 文件 该文件可以在以下位置找到这个链接 https github com yhilpisch py4fi tree master ipython source它被称为 vstoxx data 3103
python
pandas
h5py
在python中创建v7.3的.mat文件
我需要在 python 或 matlab 中执行涉及 60000X70000 矩阵的乘法 我有 16GB RAM 能够轻松加载矩阵的每一行 这就是我所需要的 我可以在 python 中创建整个矩阵 但不能在 matlab 中创建 无论如何
python
MATLAB
matrixmultiplication
h5py
matfile
尝试在 h5py 中打开 pandas 创建的 hdf 时缺少列
这就是我的数据框的样子 第一列是一个整数 第二列是 512 个整数的单个列表 IndexID Ids 1899317 0 47715 1757 9 38994 230 12 241 12228 22861131 0 48156 154 63
pandas
HDFS
HDF5
h5py
pytables
h5py 不遵守分块规范?
问题 我有现有的 netCDF4 文件 大约 5000 个 通常形状为 96x3712x3712 数据点 float32 这些文件的第一维是时间 每天一个文件 第二维和第三维是空间维 目前 在第一维上制作切片 即使是部分切片 会花费大量时间
python
h5py
netcdf4
为了实现快速读/写性能(在 Python/pandas 中),推荐的 HDF5 压缩是多少?
我曾多次读到 在 HDF5 中打开压缩可以带来更好的读 写性能 我想知道什么理想的设置可以在以下位置实现良好的读 写性能 data df to hdf format fixed complib complevel chunksize 我已经
pandas
Compression
HDF5
HPC
h5py
如何复制部分或骨架 h5py 文件
我对这个问题有几个疑问 我意识到这可能是一篇复杂的文章 可以提供额外的细节 我使用的代码包可以生成大型 h5 文件 source h5 100 Gb 其中几乎所有数据都驻留在 1 个数据集 group2 D 中 我想使用 Python 创建
python
h5py
无法安装h5py
我正在尝试安装h5py http www h5py org 但是当我这样做时pip install h5py or use python setup py install从源代码来看 致命错误 hdf5 h No such file or
python
pip
package
h5py
如何使用h5py将数据写入复合数据?
我知道在c我们可以使用轻松构建复合数据集struct逐块键入并分配数据 我目前正在实施类似的结构Python with h5py import h5py import numpy as np we create a h5 file f h5
python
NumPy
h5py
使用 HDF5 进行大型数组存储(而不是平面二进制文件)是否具有分析速度或内存使用优势?
我正在处理大型 3D 数组 我经常需要以各种方式对其进行切片以进行各种数据分析 典型的 立方体 可以约为 100GB 并且将来可能会变得更大 看来Python中大型数据集的典型推荐文件格式是使用HDF5 h5py或pytables 我的问题
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NumPy
HDF5
pytables
h5py
具有版本控制的 HDF5 文件 (h5py) - 每次保存时哈希值都会更改
我正在使用 h5py 将数值工作的中间数据存储在 HDF5 文件中 我的项目处于版本控制之下 但这不适用于 HDF5 文件 因为每次重新运行生成 HDF5 文件的脚本时 即使其中的数据没有变化 二进制文件也会发生变化 这是一个小例子来说明这
python
HDF5
h5py
如何在h5py中指定自定义压缩过滤器
根据 h5py 文档 压缩过滤器可以由底层 HDF5 库动态加载 这是通过将过滤器编号作为压缩参数传递给 Group create dataset 来完成的 我有以下代码 效果很好 import numpy as np a np rando
python
HDF5
h5py
在 H5PY 中打开文件时出错(未找到文件签名)
我一直在使用以下代码来打开一些 HDF5 文件 这些文件是在 MATLAB 中使用 H5PY 在 python 中生成的 import h5py as h5 data dataset mat f h5 File data r 但是我收到以下
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MATLAB
h5py
在h5py中,什么是类型“|O”?
调试使用 h5py 的程序 hdf5 应该看起来像这样 test hdf5 labels lt DataSet train lt Group I do gt gt gt import h5py gt gt gt test h5py File
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