在分析 Cython 代码时,什么是“stringsource”?

2024-03-19

我有一个繁重的 Cython 函数,我正在尝试优化它。我正在根据以下教程进行分析http://docs.cython.org/src/tutorial/profiling_tutorial.html http://docs.cython.org/src/tutorial/profiling_tutorial.html。我的个人资料输出如下所示:

   ncalls  tottime  percall  cumtime  percall filename:lineno(function)
        1    7.521    7.521   18.945   18.945 routing_cython_core.pyx:674(resolve_flat_regions_for_drainage)
  6189250    4.964    0.000    4.964    0.000 stringsource:323(__cinit__)
  6189250    2.978    0.000    7.942    0.000 stringsource:618(memoryview_cwrapper)
  6009849    0.868    0.000    0.868    0.000 routing_cython_core.pyx:630(_is_flat)
  6189250    0.838    0.000    0.838    0.000 stringsource:345(__dealloc__)
  6189250    0.527    0.000    0.527    0.000 stringsource:624(memoryview_check)
  1804189    0.507    0.000    0.683    0.000 routing_cython_core.pyx:646(_is_sink)
    15141    0.378    0.000    0.378    0.000 {_gdal_array.BandRasterIONumPy}
        3    0.066    0.022    0.086    0.029 /home/rpsharp/local/workspace/invest-natcap.invest-3/invest_natcap/raster_utils.py:235(new_raster_from_base_uri)
    11763    0.048    0.000    0.395    0.000 /usr/lib/python2.7/dist-packages/osgeo/gdal_array.py:189(BandReadAsArray)

具体来说,我对第 2 行和第 3 行调用感兴趣stringsource:323(__cinit__) and stringsource:618(memoryview_cwrapper)多次。谷歌显示了对内存视图的引用,尽管我静态输入 numpy 数组,但我没有在该函数中使用它。知道这些调用是什么以及我是否可以避免/优化它们吗?


好吧,事实证明我did有记忆视图。我正在调用一个内联函数,该函数将静态类型的 numpy 数组传递到内存视图,从而调用对 stringsource 的所有额外调用。将函数调用中的 memoryview 类型替换为 numpy 类型可以解决此问题。

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