我可以为我的 r 闪亮界面使用 index.html 和 ui.r 吗？

在参照this http://shiny.rstudio.com/articles/html-ui.html关于如何完全用 HTML 构建闪亮的应用程序，我想知道是否有任何方法可以将这种方法与传统的 ui.r 方法结合使用。

Reason: This http://blog.ae.be/combining-the-power-of-r-and-d3-js/将 D3 与 R Shiny 一起使用的方法似乎需要将所有 D3 代码放入 index.html 文件中。但我也想要一些交互性（selectInputs、dateRangeInputs、多个选项卡等）。有什么建议吗？

您可以使用tags http://shiny.rstudio.com/articles/tag-glossary.html将自定义 HTML 添加到您的ui.R.

对于更复杂的输出，您可以在使用具有以下功能的应用程序时构建自定义闪亮输出ui.R and server.R. 这一页 http://shiny.rstudio.com/articles/building-outputs.html有关于如何对任何代码执行此操作的信息。

以下是使用您发布的 D3 示例中的 javascript 代码的示例。 该应用程序只是生成绘图，我添加了一个selectInput您可以在其中选择它绘制的数据以显示事物如何集成。所有 javascript 代码均由 mbostock 提供。 （可以被找寻到here http://bl.ocks.org/mbostock/7607999).

我添加了闪亮的绑定部分并更改了几行以使其适应应用程序，我在上面评论了更改，以便您可以跟踪它们。

ui.R

library(shiny)

shinyUI(
  fluidPage(singleton(tags$head(
    #adds the d3 library needed to draw the plot
    tags$script(src="http://d3js.org/d3.v3.min.js"),

    #the js script holding the code to make the custom output
    tags$script(src="HierarchicalEdgeBundling.js"),

    #the stylesheet, paste all that was between the <style> tags from your example in the graph_style.css file
    tags$link(rel = "stylesheet", type = "text/css", href = "graph_style.css")
  )),
    mainPanel(

      #this select input allows the user to choose json files in the www directory
      selectInput("data_files", "JSON files:" ,  as.matrix(list.files(path="www",pattern="json"))),

      #this div will hold the final graph
      div(id="graph", class="HierarchicalEdgeBundling")
    )        
  )
)

server.R

shinyServer(function(input, output, session) {

  #output to the graph div
  output$graph <- reactive({
    #get the selected file
    input$data_files
  })
})

HierarchicalEdgeBundling.js

//shiny output binding
var binding = new Shiny.OutputBinding();

binding.find = function(scope) {
        return $(scope).find(".HierarchicalEdgeBundling");
};



binding.renderValue = function(el, data) {
//empty the div so that it removes the graph when you change data
  $(el).empty()

if(data!=null){
  var diameter = 960,
      radius = diameter / 2,
      innerRadius = radius - 120;

  var cluster = d3.layout.cluster()
      .size([360, innerRadius])
      .sort(null)
      .value(function(d) { return d.size; });

  var bundle = d3.layout.bundle();

  var line = d3.svg.line.radial()
      .interpolate("bundle")
      .tension(.85)
      .radius(function(d) { return d.y; })
      .angle(function(d) { return d.x / 180 * Math.PI; });

  //select the div that has the same id as the el id 
  var svg = d3.select("#" + $(el).attr('id')).append("svg")
      .attr("width", diameter+300)
      .attr("height", diameter+300)
    .append("g")
      .attr("transform", "translate(" + radius + "," + radius + ")");

  var link = svg.append("g").selectAll(".link"),
      node = svg.append("g").selectAll(".node");

  //add the data from the user input
  d3.json(data, function(error, classes) {
    var nodes = cluster.nodes(packageHierarchy(classes)),
        links = packageImports(nodes);

    link = link
        .data(bundle(links))
      .enter().append("path")
        .each(function(d) { d.source = d[0], d.target = d[d.length - 1]; })
        .attr("class", "link")
        .attr("d", line);

    node = node
        .data(nodes.filter(function(n) { return !n.children; }))
      .enter().append("text")
        .attr("class", "node")
        .attr("dy", ".31em")
        .attr("transform", function(d) { return "rotate(" + (d.x - 90) + ")translate(" + (d.y + 8) + ",0)" + (d.x < 180 ? "" : "rotate(180)"); })
        .style("text-anchor", function(d) { return d.x < 180 ? "start" : "end"; })
        .text(function(d) { return d.key; })
        .on("mouseover", mouseovered)
        .on("mouseout", mouseouted);
  });

  function mouseovered(d) {
    node
        .each(function(n) { n.target = n.source = false; });

    link
        .classed("link--target", function(l) { if (l.target === d) return l.source.source = true; })
        .classed("link--source", function(l) { if (l.source === d) return l.target.target = true; })
      .filter(function(l) { return l.target === d || l.source === d; })
        .each(function() { this.parentNode.appendChild(this); });

    node
        .classed("node--target", function(n) { return n.target; })
        .classed("node--source", function(n) { return n.source; });
  }

  function mouseouted(d) {
    link
        .classed("link--target", false)
        .classed("link--source", false);

    node
        .classed("node--target", false)
        .classed("node--source", false);
  }

  d3.select(self.frameElement).style("height", diameter + "px");

  // Lazily construct the package hierarchy from class names.
  function packageHierarchy(classes) {
    var map = {};

    function find(name, data) {
      var node = map[name], i;
      if (!node) {
        node = map[name] = data || {name: name, children: []};
        if (name.length) {
          node.parent = find(name.substring(0, i = name.lastIndexOf(".")));
          node.parent.children.push(node);
          node.key = name.substring(i + 1);
        }
      }
      return node;
    }

    classes.forEach(function(d) {
      find(d.name, d);
    });

    return map[""];
  }

  // Return a list of imports for the given array of nodes.
  function packageImports(nodes) {
    var map = {},
        imports = [];

    // Compute a map from name to node.
    nodes.forEach(function(d) {
      map[d.name] = d;
    });

    // For each import, construct a link from the source to target node.
    nodes.forEach(function(d) {
      if (d.imports) d.imports.forEach(function(i) {
        imports.push({source: map[d.name], target: map[i]});
      });
    });

    return imports;
  }
}
};

//register the output binding
Shiny.outputBindings.register(binding, "HierarchicalEdgeBundling");

要使应用程序正常工作，您需要创建一个www与您的文件夹位于同一目录中ui.R and server.R并放入其中HierarchicalEdgeBundling.js文件，找到的csshere http://bl.ocks.org/mbostock/7607999 in a graph_style.css文件和 json 数据文件（例如数据1.json http://vanhumbeecka.github.io/R-and-D3/blogdata.json or 数据2.json https://gist.githubusercontent.com/mbostock/1044242/raw/7b3997f1556f1ea862d462b3d73d70ed6bc68ea3/readme-flare-imports.json).