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pytables 的写入速度比 h5py 快得多。为什么?
我注意到 如果我使用 h5py 库而不是 pytables 库 则编写 h5 文件需要更长的时间 是什么原因 当之前已知数组的形状时也是如此 此外 我使用相同的块大小并且没有压缩过滤器 以下脚本 import h5py import tab
python
h5py
pytables
如何为组创建属性并在 hdf5 文件系统中访问它们?
我想在 hdf5 文件中创建两个组 第一组 h5md团体简介和 颗粒 脂质组组2描述 前者仅包含一个直接属性 版本 1 0 和两个组创建者和作者及其属性 因此这里没有数据集 在 粒子 脂质组中 唯一缺少的部分是盒子组盒组说明 最少的信息是两
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HDF5
h5py
使用 h5py 沿新轴将数据添加到现有 h5py 文件
我有一些生成 3d Numpy 数组的示例代码 然后我使用 h5 文件将此数据保存到 h5py 文件中 然后我如何沿着第四维 附加 第二个数据集 或者 我如何沿着现有的第四维 或新轴 编写另一个 3D 数据集 h5文件 我已经阅读了我能找到
python27
NumPy
HDF5
h5py
h5py 将虚拟数据集读取到 NumPy 数组时出错
我正在尝试从使用 h5py 创建的虚拟 HDF 数据集加载数据 但在正确加载数据时遇到一些问题 这是我的问题的一个例子 import h5py import tools as ut virtual h5py File ut params p
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HDF5
h5py
h5py.File(path) 无法识别文件夹路径
我在我的项目文件夹中调用 project 我有两个神经网络 h5 文件 一个位于 project my folder my model 1 h5 中 我还将其复制到文件夹 project my model 2 h5 中 所以我打开在 pro
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path
jupyternotebook
load
h5py
h5py 编写:如何高效地将数百万个 .npy 数组写入 .hdf5 文件?
我必须将大图像的子样本存储为 npy大小为 20 20 5 的数组 为了在训练分类模型时进行统一采样 我正在寻找一种有效的方法来存储近 1000 万个子样本 以实现这一点 如果我将它们存储为整个图像 则训练期间的采样将不能代表分布 我有存储
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NumPy
Bigdata
HDF5
h5py
使用 h5py 打乱 HDF5 数据集
我有一个很大的 HDF5 文件 30GB 我需要对每个数据集中的条目 沿着 0 轴 进行洗牌 浏览 h5py 文档我也找不到randomAccess or shuffle功能 但我希望我错过了一些东西 有谁足够熟悉 HDF5 来想出一种快速
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HDF5
h5py
在 matplotlib 中使用动画的颜色图问题
I use matplotlib animation对名为 3D 的数组中的数据进行动画处理arr 我使用 h5 文件读取数据h5py图书馆一切都很好 但是 当使用动画时 颜色图卡在数据范围的第一帧中 并且经过一些步骤后 它在绘图时显示非标
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Animation
matplotlib
colormapping
h5py
核心 4D 图像 tif 存储为 hdf5 python
我有 27GB 的 2D tiff 文件 代表 3D 图像电影的切片 我希望能够像简单的 numpy4d 数组一样对这些数据进行切片 看起来 dask array 是一个很好的工具 可以在数组作为 hdf5 文件存储在内存中后干净地操作数组
python
h5py
Dask
RuntimeError:当我附加 hdf5 文件时无法创建链接(名称已存在)?
我正在尝试将 hdf5 数据集附加到之前的 hdf5 数据集发生以下错误 h5o link obj id self id 名称 lcpl lcpl lapl self lapl 文件 h5py objects pyx 第 54 行 在 h5
python3x
file
HDF5
h5py
如何使用 h5py 导入 .mat-v7.3 文件
我有 mat 文件 其中有 3 个矩阵 A B C 实际上我使用 scipy io 导入这个 mat 文件 如下所示 data sio loadmat data mat A data A B data B C data C 但是 v7 3
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MATLAB
HDF5
h5py
hdf5storage
h5py OSError:无法打开文件(未找到文件签名)
我对使用 h5py 时收到的错误感到有点困惑 我正在尝试应用 python 脚本来循环访问位于不同目录中的 h5py 文件集 例如 第一组 h5py 文件位于 减少 rho 0 75 2 数据 快照 当我运行 python 脚本时fromR
python
h5py
python h5py:我可以存储不同列具有不同类型的数据集吗?
假设我有一个表 有很多列 只有几列是浮点类型 其他都是小整数 例如 col1 col2 col3 col4 1 31 1 2 3 2 33 3 5 4 假设我使用 我怎样才能有效地存储它np float32对于这个数据集 存储被浪费了 因为
python
HDF5
h5py
如何将 Pandas Dataframe 写入 HDF5 数据集
我正在尝试将 Pandas 数据帧中的数据写入嵌套的 hdf5 文件中 每个组内有多个组和数据集 我想将其保留为单个文件 该文件将来每天都会增长 我尝试了以下代码 它显示了我想要实现的目标的结构 import h5py import num
python3x
pandas
HDF5
h5py
在 OS X 上安装 h5py
我花了一天的时间试图得到h5pypython 模块工作 但没有成功 我已经安装了 HDF5 共享库 并按照我在网上找到的说明进行操作以使其正确 但它不起作用 下面是我尝试将模块导入 python 时收到的错误消息 我也尝试通过 MacPor
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MacOS
import
HDF5
h5py
创建 HDF5 文件而不关闭它们时损坏文件 (h5py)
我正在使用 h5py 将实验数据存储在 HDF5 容器中 在交互式会话中 我使用以下命令打开文件 measurement data h5py File example hdf5 a 然后我使用一些自写函数将数据写入文件 可以是几天实验中的许
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corruption
h5py
使用 h5py 将光栅图像添加到 HDF5 文件
如果这是一个新手问题 我很抱歉 但我对 Python 和 HDF5 相当陌生 我正在使用 h5py numpy 和 Python 2 7 我有来自各种文件的数据需要导入到一个 HDF5 文件中 每个文件的数据将存储在不同的组中 每个组都需要
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NumPy
HDF5
Raster
h5py
h5py,访问SVHN中Datasets中的数据
我想读书街景门牌号 SVHN 数据集通过使用h5py In 117 def printname name print name In 118 data digitStruct visit printname bbox name 数据中有两组
python
h5py
H5py存储字符串列表的列表
h5py 是否有可能创建一个由字符串列表组成的数据集 我尝试创建一个可变长度的嵌套数据类型 但这会导致我的 python 解释器出现分段错误 def create dataset h5py file data I am a sentecne
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HDF5
h5py
h5py存取简例
当数据太大 好像是 gt 2G scipy io savemat 会报错 考虑换用 h5py 这种格式 matlab 也可以读 见 4 Code import numpy as np import h5py a np arange 12 r
机器学习
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scipy
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