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openMPI/mpich2 不能在多个节点上运行
我正在尝试在多节点集群上使用 install openMPI 和 mpich2 但在这两种情况下 我在多台计算机上运行时都遇到问题 使用 mpich2 我可以从头节点在特定主机上运行 但是如果我尝试从计算节点到不同节点运行某些内容 我会得到
Networking
MPI
OpenMPI
sungridengine
MPICH
SunGridEngine、Condor、Torque 作为 PVM 的资源管理器
有人知道哪个资源管理器适合 PVM 吗 或者我不应该使用 PVM 而是依赖 MPI 或其任何版本 例如 MPICH 2 还有其他更好的吗 使用 PVM 的主要原因是因为在我之前开始这个项目的人假设使用 PVM 然而 现在这个项目是我的了 他
clustercomputing
HPC
sungridengine
pvm
如何控制提交网格作业时使用的 Perl 版本?
我正在与 SGE Sun Grid Engine 合作将作业提交到网格 我也用perlbrew管理我安装的 Perl 版本 我写了一些短文sh我用来运行需要特定 Perl 版本 5 12 2 的 perl 脚本的脚本 如下所示 bin ba
perl
bash
grid
perlbrew
sungridengine
如何在qsub中指定错误日志文件和输出文件
我有一个 qsub 脚本 submit job sh bin sh N job1 t 1 100 cwd SEEDFILE home user1 data1 SEED sed n e SGE TASK ID p SEEDFILE home
bash
clustercomputing
qsub
sungridengine
SnakeMake中使用Conda环境上SGE集群问题
有关的 使用 Python 脚本 conda 和 cluster 的 SnakeMake 规则 https stackoverflow com questions 45801643 snakemake rule with python sc
python
conda
qsub
sungridengine
snakemake
SGE 提交的作业状态不会从“qw”改变
我在 ubuntu 14 04 上使用 Sun Grid Engine 对要在多核 CPU 上运行的作业进行排队 我已经在我的系统上安装并设置了 SGE 我创建了一个 hello world 目录 其中包含两个 shell 脚本 即 hel
jobscheduling
qsub
sungridengine
在 SLURM 中运行没有顶级脚本的二进制文件
在 SGE PBS 中 我可以像在本地一样向集群提交二进制可执行文件 例如 qsub b y cwd echo hello 将提交一个名为 echo 的作业 该作业将单词 hello 写入其输出文件 我如何向 SLURM 提交类似的工作 它
bash
clustercomputing
pbs
sungridengine
slurm