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如何忽略 Snakemake 的“自上次执行以来参数已更改”？

2024-03-22

由于 conda 环境不活跃，工作流程的一些非常晚的作业崩溃了。

现在，当我尝试使用重新运行时snakemake deploy_all --ignore-incomplete所有作业都会从头开始重新运行，原因如下：

Reason: Params have changed since last execution

我怎样才能使snakemake不重新运行所有规则，并接受已有的任何输入？

This 行为改变 https://github.com/snakemake/snakemake/issues/1694似乎是 7.8.0 版本以来的新内容。


v7.8.0 中的重新运行行为似乎发生了变化，请参阅此公告：https://github.com/snakemake/snakemake/issues/1694 https://github.com/snakemake/snakemake/issues/1694

要恢复旧的行为，需要附加

--rerun-triggers mtime

--touch有时可能有效，但有时则无效。

当我跑的时候--touch重新运行原因更改为

reason: Code has changed since last execution
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snakemake

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